MSTS i sig har inget stöd för joysticks/spelkontroller. Hur man gjort med Raildriver vet jag inte riktigt dock.
Däremot finns det ett program som heter "JoyToKey" som gör att man kan låta joystickens rörelse gå över och bli till en tangentbordstryckning i datorn, och på så sätt köra MSTS. Har själv kört MSTS med en yoke på ett sådant sätt, men det kan vara lite krångligt.
Googla på JoyToKey så ska du nog hitta något